17-летний Синпэй возвращается из Токио на свой родной остров, где провёл детство, чтобы посетить похороны Усио, с которой вырос. Вскоре он обнаруживает, что в её причине смерти — несчастном случае при попытке спасти тонущую девочку — есть множество несостыковок. Чем глубже Синпэй начинает узнавать детали случившегося, тем больше понимает, что смерть не была простым роковым совпадением.
Прошло немало времени с тех пор, как Эмилия пробудилась ото сна посреди заснеженного леса. Осознав, что ничего не помнит о прошлой жизни, девушка начинает учиться жить с нуля. В этом ей помогают её новые знакомые: Пак — немного странный, но очень заботливый и добрый Великий дух, и молчаливые Младшие духи, помогающие ей в повседневности. Отныне её жизнь состоит из обыденных забот.
Действие посвящено боевой биографии Дюнан и Бриарея до попадания в Олимп.
2029 год. Благодаря значительным достижениям в кибернетике люди могут заменять свои конечности роботизированными частями. Майор Мотоко Кусанаги из 9-го отдела службы безопасности ведёт расследование, связанное с таинственным хакером, который называет себя Кукловод.
В агентство Саеба приходит молодая особа с просьбой отыскать ее отца, который как считается умер много лет назад. Главе агентства Рё, все по плечу, и поиски пропавших людей, и ухаживание за миловидными клиентками. Но в этот раз детективам не до смеха. Кто-то охотится за девушкой.
Спустя 31 год после Третьей мировой войны и ядерной бомбардировки столицы Японии, воссоздан новый город - Нью-Токио. Внешне все под контролем, однако страна теперь напоминает профашистское государство, жесточайшим образом подавляющее попытки мятежа. В исследовательских центрах проводятся парапсихологические опыты над людьми для разработки совершенного вида оружия.
Рё Саэба — своеобразный «чистильщик», который стремится очистить Токио от преступности.
На далёкой планете Кибертрон существовала цветущая цивилизация разумных роботов Трансформеров, делящихся на солдатов Десептиконов и тружеников Автоботов. Лидер первых властолюбивый Мегатрон развязал войну с мирными соседями, которая, истощив энергоресурсы планеты, поставила цивилизацию Кибертрона на край гибели.