Старшеклассник Хикару отправился в одиночку на гору и пропал, а через неделю вернулся живой и невредимый. Через полгода его лучший друг и одноклассник Ёсики, давно подозревающий неладное, задаёт прямой вопрос и получает прямой ответ: Хикару умер, а в его тело вселилось нечто, само не знающее, что оно такое, но оно очень хочет жить в качестве человека и совсем не хочет убивать Ёсики.
В Каракуре, родном городе Итиго Куросаки, начинают пропадать люди, а Общество душ фиксирует внезапный рост количества «пустых», уничтоженных в мире живых. Вскоре Итиго предстоит вступить в битву с лидером квинси, который собирается уничтожить Общество душ.
Европа XIX века. Студент Джон Уотсон был завербован службой разведки в качестве секретного агента. Технократия — мир, где наука совершила невероятный прорыв для любой промышленности. Создание гомункулов поставлено на поток, и существа с мёртвыми телами и искусственной душой используются во всех сферах жизни в роли солдат и рабочей силы.
Доктор Кэндзо Тэнма — талантливый хирург, который работает в Германии. Однажды он спасает тяжело раненого мальчика. Этот случай послужит началом череды загадочных убийств, а спустя годы Кэндзо вновь столкнётся с тем, кого он когда-то спас от смерти.