1909 год, северно-восточная Гренландия. Датская экспедиция во главе с Эйнаром Миккельсеном занимается поисками пропавших без вести предшественников, которые пытались доказать целостность Гренландии и её полную принадлежность Дании вопреки утверждениям американцев, что она разделена на две части проливом Пири.
На острове Нублар, где не так давно располагался парк развлечений с динозаврами, правит бал дикая природа, но внезапно пробудившийся вулкан угрожает стереть динозавров с лица земли. Бывшая управляющая парком Клэр Диринг переквалифицировалась в защитницу исчезающих видов и пытается сделать всё, чтобы спасти доисторических животных.
Стареющий король Лир решает разделить власть между тремя дочерьми, если те докажут ему свою любовь. Младшая дочь не приемлет лести и за это отправляется в изгнание, а две старшие заискивают перед отцом и получают королевство. Добившись желаемого, они обнажают свои истинные намерения и выступают против Лира, который сам становится изгнанником.
Поиск и изучение необычайных волшебных существ приводят магозоолога Ньюта Саламандера в Нью-Йорк. Скорее всего, он отбыл бы на поезде дальше, если бы не немаг (так в Америке называют магглов) по имени Якоб, оставленный в неположенном месте магический чемодан и побег из него фантастических животных Ньюта.
1961 год. Первая советская атомная подводная лодка терпит аварию из-за неполадок в ядерном реакторе. Предотвратить крупную ядерную аварию и потенциальную Третью мировую войну может только экипаж подлодки под командованием капитана Алексея Вострикова.