В последние дни Второй мировой камикадзе Коити Сикисима посадил самолёт на острове Одо, где располагалась ремонтная база императорской армии Японии. В тот же вечер на них напал непонятно откуда взявшийся огромный ящер Годзилла — именно так называли его местные. Коити возвращается в разрушенный бомбардировками Токио (родители погибли, от дома остались одни обломки) и пытается жить дальше.
16-летняя Судзумэ живёт в тихом городке на острове Кюсю. Однажды по дороге в школу она встречает молодого путешественника, который спрашивает, где в окрестностях находятся развалины. Любопытство берёт верх, и девушка решает посмотреть, что же там такого интересного — пробирается на местную заброшку, находит там загадочную дверь, открывает её и вытаскивает из земли странный камень.
Иокогоама, 1879 год. Бывший убийца Кэнсин пытается вести тихую мирную жизнь с любимой девушкой Каору, но его настигает прошлое в лице младшего брата покойной жены. Теперь Энъиси возглавляет китайскую преступную группировку и, так и не смирившись с гибелью сестры, бросает все силы на месть Кэнсину — взрывает его любимый ресторан и организовывает нападения на местные додзё.
16-летний Ходака Морисима убегает из дома в Токио, где у него сразу кончаются деньги. Мало того, что без документов он не может найти работу, так ещё на улице идёт бесконечный дождь, и небо постоянно затянуто тучами. В отчаянии парень обращается к бывшему попутчику, а тот не только берёт его в свой журнал, пишущий о сверхъестественном, но и предоставляет жильё.
Хамура Юдзуру – студент университета и фанат детективных романов. Против своей воли он присоединяется к детективному клубу, которым управляет Акэти Кёсукэ. Вскоре с ними знакомится Кэндзаки Хируко, которая учится в том же университете и является частным детективом. Вместе они отправляются в пансион Сидзинсо, где сразу же вынуждены забаррикадироваться в здании из-за нашествия зомби.
Если в деревне у бабушки нет твоих сверстников, только старики и старушки, любые каникулы могут превратиться в наказание. Сосланная родителями на лето в глухую деревню 10-летняя Мэри каждый день не знает, чем себя занять. Однажды девочка решает проследить за приблудным котом и случайно находит в лесу волшебный цветок.
Токийский парень Таки и провинциальная девушка Мицуха обнаруживают, что между ними существует странная связь. Во сне они меняются телами и проживают жизни друг друга. Но однажды эта способность исчезает так же внезапно, как появилась. Таки решает во что бы то ни стало отыскать Мицуху.
На этот раз Кэнсин вступает в противостояние с самим Макото Сисио - злодеем, вознамерившимся свергнуть правительство Мэйдзи и подчинить себе всю Японию. Судьба страны висит на волоске, и скиталец-самурай Химура вновь берет в руки меч, к которому он поклялся никогда не прикасаться.
В Киото появляется жестокий и расчетливый убийца Макато Сисио, который пытается свергнуть действующую власть и прибрать её в свои руки. Кроме Кэнсина некому защитить правительство Японии, которое сейчас так сильно нуждается в помощи. Химура — единственный, кто может противостоять Макато. Тем более, что ему всегда готовы помочь верные друзья.
История о молодом пилоте Чарльзе Карино, наёмнике имперских войск Левамм. Ему приходится отправиться на особо секретное задание, цель которого - сопроводить княжескую невесту Леди Фану де Морал в столицу. На пути во всю идет война за земли, и войскам ополчения Аматсавиан удалось перехватить детали задания, поэтому план придется немного поменять.