В 1935 году Билли Батгейт — всего лишь обычный уличный мальчишка, один из многих. Проходит несколько лет, и он становится широко известен в криминальных кругах, поскольку входит в банду знаменитого босса мафии Голландца Шульца. Билли успешно продвигается по преступной карьерной лестнице, пока не встречает девушку своей мечты.
Четыре черепашки и крыса в канализационных трубах Нью-Йорка вляпались в радиационные отходы, мутировали и превратились в человеческого роста разумных черепашек, а крыса, которая раньше жила у японского мастера ниндзя-цу, обучила их боевым искусствам. Черепашки Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло подружились с тележурналисткой и помогли остановить рост молодежной преступности.