В последние дни Второй мировой камикадзе Коити Сикисима посадил самолёт на острове Одо, где располагалась ремонтная база императорской армии Японии. В тот же вечер на них напал непонятно откуда взявшийся огромный ящер Годзилла — именно так называли его местные. Коити возвращается в разрушенный бомбардировками Токио (родители погибли, от дома остались одни обломки) и пытается жить дальше.
Киото, 2027 год. Стеснительный школьник Наоми Катагаки боится даже говорить вслух в классе, а о том, чтобы признаться в симпатии однокласснице, речи вообще не идёт. Однажды по дороге из школы парень видит в небе непонятное свечение, из которого появляется ворона и утаскивает у него книгу. Погнавшись за птицей и испытав ещё более загадочное искривление пространства, Наоми встречает молодого...
Хамура Юдзуру – студент университета и фанат детективных романов. Против своей воли он присоединяется к детективному клубу, которым управляет Акэти Кёсукэ. Вскоре с ними знакомится Кэндзаки Хируко, которая учится в том же университете и является частным детективом. Вместе они отправляются в пансион Сидзинсо, где сразу же вынуждены забаррикадироваться в здании из-за нашествия зомби.
Веселая компания из шести друзей детства, звавших себя «супермиротворцы», распалась с трагической смертью девочки Мэйко Хонма. Дзинта Ядоми, признанный лидер группы, начал винить себя в смерти подруги и отдалился от всех, став классическим хикикомори. Остальные ребята пошли разными путями – кто-то поступил в престижную старшую школу, кто-то старается жить обычной жизнью, кое-кто вообще подался...
Действие происходит в ближайшем будущем... Адвокату Фениксу Райту для того, чтобы выступить в защиту и доказать невиновность своей клиентки Майи Фей, приходится столкнуться в суде со своим другом детства Майлзом Эджуортом, являющимся теперь Главным обвинителем. Нынешняя правовая система отводит на судебный процесс только три дня, прежде чем судья примет решение о виновности или невиновности...